Ritsuko Akagi
Direttrice del progetto Evangelion, Ristuko è un'amica di vecchia data di Misato, con la quale ha sempre avuto, sin dai tempi dell'università, uno strano rapporto giocato al confine tra l'ammirazione e l'invidia. Dietro una facciata di gelida scienziata senza scrupoli, Ritsuko cela infatti un animo molto più umano di quello che si potrebbe pensare. Forse proprio per questo i grandi segreti della Nerv, dei quali è perfettamente al corrente, iniziano a pesare troppo sulla sua coscienza.
Gendo Ikari
Comandante supremo della Nerv, Gendo Ikari è un uomo spregiudicato e risoluto. Il suo passato è avvolto dal mistero. I veri intenti di Gendo sono ugualmente misteriosi, e, sebbene egli sia teoricamente alle dipendenze del "Comitato per la strumentalità o perfezione dell'uomo" (la Zeele) presieduto da Kiele Lorentz, è difficile immaginare a cosa miri in realtà. L'unica persona con la quale sembra mostrare una minima umanità è Rei Ayanami, mentre con il suo secondo in comando, Kozo Fuyitsuki, pare avere uno strano rapporto di complicità.
Kozo Fuyutsuki
Anziano vice-comandante della Nerv, Fuyutsuki conosce Gendo da lungo tempo e sembra avere con lui uno strano rapporto di complicità e pacata ammirazione.
Ryoji Kaji
Ex-ragazzo di Misato Katsuragi, Kaji è attualmente un diretto dipendente di Gendo Ikari, segretamente incaricato della gestione dei servizi segreti della Nerv. E' tornato in Giappone dopo un lungo soggiorno in Germania ed in America, dove ha seguito l'allenamento di Asuka, diventandone tutore legale e "principe azzurro". Anche se vorrebbe far credere il contrario, soprattutto a Misato, conosce molte più verità di quanto si potrebbe immaginare...
Keel Lorentz
Presidente del "comitato per la strumentalità o perfezione dell'uomo", è forse il burattinaio che muove le fila della Nerv fin dai tempi del Second Impact.
Pen Pen
Esemplare di una nuova razza di pinguino, detta "delle sorgenti termali", Pen Pen è il bizzarro animale domestico di Misato. Vive in un apposito frigorifero e sembra essere dotato di una razionalità quasi umana.